Zestaw służy do jakościowego wykrywania in vitro genów ORF1ab/N/S nowego koronawirusa 2019-nCoV w próbkach z dróg oddechowych, w tym wymazów z jamy ustnej i gardła, wymazów z nosogardzieli, plwociny oraz jednoczesnego typowania mutacji na HV69-70 del.Jak podano w bazie danych GISAID, ponad 95% zgłoszonych wariantów sekwencji Omicron obejmuje delecję w HV69-70, co może powodować niepowodzenie docelowego genu S (SGTF) w testach PCR.SGTF może być używany jako znacznik proxy do badań przesiewowych w kierunku Omicron.
Zestawy starterów i sonda znakowana FAM są przeznaczone do specyficznego wykrywania genu ORF lab 2019-nCoV, sondy znakowanej VIC dla genu N 2019-nCoV, sondy znakowanej ROX dla mutacji genu S HV69-70 del 2019-nCoV.Gen ludzkiej RNazy P wyekstrahowany jednocześnie z próbką testową zapewnia kontrolę wewnętrzną w celu sprawdzenia procedury ekstrakcji jąder i integralności odczynnika.Sonda ukierunkowana na ludzki gen RNazy P jest znakowana CY5.
System PCR w czasie rzeczywistym: Aehealth Diagenex AL, ABI 7500, ViiATM 7, Quant Studio 7 flex.Roche Lightcycler 480, Agilent Mx3000P/3005P, Rotor-GeneTM6000/0.Bio-Rad CEX96 TouchTM SLAN-96S.SLAN-96P, MA 6000;